截至2008年末，新疆维吾尔自治区分行共投放2008棉花年度收购贷款285.08亿元，同比增加13.58亿元，支持企业收购皮棉4498万担，同比增加426万担，为促进新疆经济发展、保护农民利益和保持社会稳定发挥了积极作用。
2008年，新疆棉花生产规模继续保持高位水平，随着商业银行贷款入市收购量减少，农发行贷款支持份额相应增加。但棉花市场持续低迷、棉价大幅下滑，尤其是受国际金融危机的影响，国内纺织品市场积弱难返，导致棉花消费量萎缩，棉花购销形势严峻。
为确保新棉收购工作正常进行，该行认真组织开展贷款资格认定工作，合理摆布资金供应点。对原贷款企业资格进行了分期分批认定工作，从严从紧选择列入技改规划、资质好的新企业纳入支持范围。共有179家棉花企业获得2008年度贷款资格，确保每个棉花主产县(市)都有农发行贷款支持的收购网点，并通过媒体向社会公布，方便棉农售棉，有效防止了棉花收购出现“空白点”。同时，启动信贷退出淘汰机制，对11家经营能力差、出现信贷违规问题的企业实行了退出或暂缓认定贷款资格。
参加国家储备是2008年企业销售棉花的最主要渠道，该行积极督促企业做好棉花入储工作。至2008年末，该行支持企业累计入储棉花1424万担，占棉花收购总量的32%。
