低价的进口棉花尽管满足了棉纺企业维持成本的需要，但对国内棉花种植业造成了冲击，这不仅事关上亿植棉农民的收入，同时，也不利于纺织业增加附加值和改变贸易增长方式，会导致我国棉纺业的外贸结构从原有的一般贸易为主转向加工贸易为主。
业内人士普遍认为，棉花作为一种战略物资，应当与粮食放在同等地位，亟须出台既能解决国内外棉花价格差距，又能保护棉农利益的政策。
中国入世后为了履行有关承诺，对原有的农产品财政补贴性政策做了很大的调整。现有仅有的很少的补贴政策都将在“十一五”期间取消。农业部农村经济研究中心研究员杜珉说，届时我国棉花生产没有任何扶持政策措施，这与我们棉花大国地位，与我们发展中国家的经济状况，以及WTO协议的绿箱政策是不相称的。
中国棉纺织行业协会会长徐文英认同这种观点，他说，解决国内外棉价接轨的问题已经十分紧迫。抓紧研究既放开进口棉花限制同时又保护棉农利益的政策已经十分必要。对于现有的棉花进口政策，北京棉花展望信息咨询有限责任公司国际部主任刘永丽则认为，仅仅用配额、滑准税等政策在产业链内部调整，必然是众口难调，需要从产业链源头注入一定的价值。
上海WTO事务咨询中心咨询部主任冯军认为，近几年进口棉大增，其中美棉最多，直接冲击国内棉商和棉农利益。在对生产、科研环节没有国家扶持的情形下，放开棉花市场，听任外棉冲入，会陷我国棉花于不利地步。
